Управление МБОУ «СОШ №6» осуществляется в соответствии с Федеральным Законом Российской Федерации № 273 от 29.12.2012 «Об образовании в Российской Федерации» и Уставом МБОУ «СОШ №6» на принципах демократичности, открытости, приоритета общечеловеческих ценностей, охраны жизни и здоровья человека, свободного развития личности.
Управление школой осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.
Единоличным исполнительным органом МБОУ «СОШ №6» является руководитель - директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью школы.
В МБОУ «СОШ №6» действуют следующие коллегиальные органы управления: педагогический совет, общее собрание трудового коллектива, Управляющий совет.
